A5創(chuàng)業(yè)網(wǎng)(公眾號(hào):iadmin5)2月1日?qǐng)?bào)道,百度研究院宣布,將向各基因檢測機(jī)構(gòu)、防疫中心及全世界科學(xué)研究中心免費(fèi)開放線性時(shí)間算法 LinearFold 以及世界上現(xiàn)有最快的RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測網(wǎng)站,以提升新型冠狀病毒RNA空間結(jié)構(gòu)預(yù)測速度,從而助力疫情防控。
據(jù)悉,該算法使得整序列、整基因組的 RNA 結(jié)構(gòu)預(yù)測成為可能,也是RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測領(lǐng)域40年來第一次重大提速。這項(xiàng)工作發(fā)表于生物信息學(xué)頂級(jí)會(huì)議 ISMB 2019 和生物信息學(xué)權(quán)威雜志 Bioinformatics,受到了諸多業(yè)內(nèi)專家的高度評(píng)價(jià)。
值得一提的是,由于新型冠狀病毒已經(jīng)在多個(gè)國家出現(xiàn),百度開放LinearFold網(wǎng)站給全世界科學(xué)家免費(fèi)使用,較同類網(wǎng)站相比,在RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測速度和序列長度方面,該網(wǎng)站都具有明顯優(yōu)勢,在預(yù)測速度上無出其右,而且能處理的最長序列長度達(dá)10萬堿基,能滿足對(duì)RNA病毒全基因組結(jié)構(gòu)預(yù)測的要求。
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